A rövid válasz: dd
A hosszú válasz: mi a gyors és kényelmes? A klónozáshoz kb. muszáj kivenni a kártyát, bár lehet ügyeskedni az élő rendszer klónozásával, vannak kétségeim, hogy mennyire kényelmes. Illetve... egyszer kell leklónozni (mondjuk évente, esetleg párhavonta), utána "bármivel" (rsync, tar, csinos mentőszoftver) menteni a változásokat, és ha beüt a ménkű, akkor visszatölteni (konkrétan így van egy rpi az öcsémnél, ráragasztottam egy sd kártyát, ha megellik amit épp használ, öcsém kicseréli, én meg vagy visszatöltöm rá az utolsó mentést, vagy csak kézzel átírom amit esetleg kell)
Ha ext4 lenne, akkor egyébként én ezt használnám: https://www.macrium.com/blog/cloning-and-imaging-linux-file-systems-39b…
És ezzel mentek "mindent": https://backuppc.github.io/backuppc/ kivéve amikor mást, mással :)